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Electronic Journal of Biotechnology ISSN: 0717-3458
  © 2011 by Universidad Católica de Valparaíso -- Chile
Vol. 14 No. 3, Issue of May 15, 2011
 

Table 3. Summary of detected specific AFLP fragments in Brassica oleracea var. capitata (B. o.) and Brassica pekinensis (B. p.) gene bank accessions.



multiplex

primer combinations

No. of
specific frag.

No. of total
detected
frag.

% of
specific frag.

average % of
specific frag.
per multiplex

average % of
specific frag.
per multiplex

MseI

EcoR1

B. o.

B. p.

B. o.+ B. p.

B. o.

B. p.

B. o.

B. p.

B. o.+ B. p.

1

CAT

ACAFAM

7

4

26

26,9

15,4

 

 

 

CAT

AGGJOE

2

4

24

8,3

16,7

24,3

14,9

39,2

CAT

ACCNED

9

3

24

37,5

12,5

 

 

 

2

CTT

ACAFAM

8

14

40

20,0

35,0

 

 

 

CTT

AGGJOE

6

6

26

23,1

23,1

27,4

26,6

54,0

CTT

ACCNED

9

5

23

39,1

21,7

 

 

 

3

CAC

ACTFAM

6

13

39

15,4

33,3

 

 

 

CAC

AAGJOE

11

10

40

27,5

25,0

27,5

25,6

53,1

CAC

AACNED

17

8

43

39,5

18,6

 

 

 

4

CAG

ACTFAM

7

7

25

28,0

28,0

 

 

 

CAG

AAGJOE

14

15

55

25,5

27,3

24,3

25,7

50,0

CAG

AACNED

8

9

41

19,5

22,0

 

 

 

5

CTC

ACTFAM

10

4

27

37,0

14,8

 

 

 

CTC

AAGJOE

7

6

36

19,4

16,7

27,9

18,1

46,0

CTC

AACNED

13

11

48

27,1

22,9

 

 

 

6

CTG

ACTFAM

8

5

28

28,6

17,9

 

 

 

CTG

AAGJOE

13

6

33

39,4

18,2

31,5

18,9

50,4

CTG

AACNED

9

7

34

26,5

20,6

 

 

 

7

CAT

ACGJOE

2

6

19

10,5

31,6

 

 

 

CAT

AGCNED

15

7

67

22,4

10,4

16,5

21,0

37,5

8

CTT

ACGJOE

5

12

30

16,7

40,0

 

 

 

CTT

AGCNED

17

9

61

27,9

14,8

22,3

27,4

49,7

9

CAC

ACGJOE

13

4

31

41,9

12,9

 

 

 

CAC

AGCNED

17

9

49

34,7

18,4

38,3

15,6

53,9

10

CAG

ACGJOE

10

5

31

32,3

16,1

 

 

 

CAG

AGCNED

11

16

53

20,8

30,2

26,5

23,2

49,7

11

CTC

ACGJOE

5

6

37

13,5

16,2

 

 

 

CTC

AGCNED

12

7

47

25,5

14,9

19,5

15,6

35,1

12

CTG

ACGJOE

5

5

17

29,4

29,4

 

 

 

CTG

AGCNED

10

8

30

33,3

26,7

31,4

28,0

59,4

frag. = AFLP fragments; FAM, JOE, NED = blue, green, yellow fluorescent dyes.